1.2 图神经网络基本原理 GNNs核心思想是通过迭代地传播信息来学习节点特征表示。这一过程往往涵盖消息传递、聚合、更新三个步骤:
1.3 常见GNN架构 目前存在多种不同GNN架构,涵盖但不限于:
class SocialNetAnalysis〔nn.Module〕: def __init__〔self〕: super〔SocialNetAnalysis, self〕.__init__〔〕 self.conv1 = GCNConv〔64, 32〕 self.conv2 = GCNConv〔32, 8〕
def forward〔self, x, edge_index〕: x = F.relu〔self.conv1〔x, edge_index〕〕 x = F.dropout〔x, training=self.training〕 x = self.conv2〔x, edge_index〕 return F.log_softmax〔x, dim=1〕 ```
2.2 化学分子性质预测 对于化学领域而言,可以通过构建分子结构图形模型来实行药物设计或材料科学研究工作: ```python from rdkit import Chem
def mol_to_graph_data_obj〔smiles〕: mol = Chem.MolFromSmiles〔smiles〕 n_atoms = mol.GetNumAtoms〔〕 # 获取所有原子类型作为输入特征矩阵X一行向量格局 X = np.zeros〔〔n_atoms, len〔atom_types〕〕〕 for atom in mol.GetAtoms〔〕: X〔atom.GetIdx〔〕, atom_types.index〔atom.GetSymbol〔〕〕〕 += 1 # 计算邻接矩阵A,并排除自环部分形成无环连通子集情况下完整邻接矩阵A' A_prime = np.zeros〔〔n_atoms + n_bonds - n_self_loops - n_isolated_nodes, n_atoms + n_bonds - n_self_loops - n_isolated_nodes〕〕 for bond in mol.GetBonds〔〕: i_from_node_id = bond.GetBeginAtomIdx〔〕 i_to_node_id = bond.GetEndAtomIdx〔〕 if not A_prime〔i_from_node_id〕〔i_to_node_id〕: A_prime〔i_from_node_id〕〔i_to_node_id〕 += 1 return {'X': X.astype〔np.float32〕, 'A': A_prime}
笔者所述,在实际应用中充分利用好GNN超强表达本事、泛化本事至关重点,咱们不止能够搞定上述提到一些特定任务需求,在更多场景下也展露出广泛应用潜力,将来研究方向大概会集中在开发更加高效且鲁棒性强新算法框架上;同时探索如何更好地整合多模态信息以进一步提升模型性能;以及针对大规模稀疏数据集设计专用硬件加速方案等方面展开探讨研究工作。
通过本篇文章学习与讨论希望能协助各位读者奠定起对于运用GNN处理复杂图形数据整体认识,并激发大家进一步探索其更多不确定性热情!
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