🚀 PubMed 分析 MCP 服务器
这是一个专业的PubMed医学文献分析MCP服务器，能助力科研人员快速洞察医学研究动态。本项目由苦逼医学生开发，目前功能仍在完善中，欢迎各位提出建议和改进！
🚀 快速开始
安装依赖
# 安装依赖
pip install -r requirements.txt
# 或使用uv
uv pip install -r requirements.txt
配置 mcp.json
因为习惯用uv虚拟环境，所以这里直接使用python的路径运行python文件。
// Add the following configuration in mcp.json (for Windows)
"PubMed": {
"command": "cmd",
"args": [
"/c",
"path/to/python.exe",
"path/to/server.py"
]
}
// For example, my mcp.json file looks like this
{
"mcpServers": {
"fetch":{
"command": "cmd",
"args": [
"/c",
"uvx",
"mcp-server-fetch"
]
},
"PubMed": {
"command": "cmd",
"args": [
"/c",
"path/to/python.exe",
"path/to/server.py"
]
}
}
}
LLM 提示 (Agent 模式)
/your_mcp_name (note: it is PubMed here) Help me analyze the research hotspots on prostate cancer immunotherapy in the past three months. Set top_n to 50 and max_results to 5000. My email adress is ...
/your_mcp_name（注：比如我的mcp.json里面是PubMed）帮我分析一下近三个月前列腺癌免疫治疗的研究热点。top_n设置为50，max_results设置为5000。我的电子邮件地址是...
✨ 主要特性
- 文献检索：支持PubMed高级检索语法，可设置日期范围和结果数量。
- 热点分析：统计关键词频率，识别热门研究方向，汇总相关文献。
- 趋势追踪：追踪关键词随时间的频率变化，揭示研究趋势演变。
- 发文统计：提供灵活的时间周期设置，分析文献数量变化。
- 全面报告：一键生成包含热点、趋势和统计的分析报告。
📦 MCP工具
1. search_pubmed
搜索PubMed并保存结果。 主要参数：
email：您的电子邮件（必填）advanced_search：PubMed搜索查询（必填，与高级检索语法相同）max_results：最大结果数（默认：1000）
2. list_result_files
列出可用的结果文件。
3. analyze_research_hotspots
分析研究热点。 主要参数：
filename：结果文件名（必填）top_n：分析的关键词数量（默认：20）
4. analyze_research_trends
分析研究趋势。
5. analyze_publication_count
分析发文数量。
6. generate_comprehensive_analysis
生成全面分析报告。
⚠️ 注意事项
⚠️ 重要提示
项目仍在开发中，功能可能尚未完善，请谨慎使用。