🚀 Scanpy MCP服务器
Scanpy MCP服务器是专门为单细胞RNA测序（scRNA-Seq）分析软件Scanpy打造的，它创新性地支持自然语言处理，为scRNA-Seq分析带来了更便捷、高效的体验。
🚀 快速开始
Scanpy MCP服务器支持自然语言处理，让单细胞RNA测序（scRNA-Seq）分析更便捷。以下是快速上手步骤：
安装
从PyPI安装：
pip install scanpy-mcp
您可以通过运行以下命令进行测试：
scmcp run
本地运行scanpy-server
在您的MCP客户端中参考以下配置：
"mcpServers": {
"scanpy-mcp": {
"command": "scmcp",
"args": [
"run"
]
}
}
远程运行scanpy-server
在服务器上运行：
scmcp run --transport sse --port 8000
然后配置您的MCP客户端，例如：
http://localhost:8000/sse
✨ 主要特性
- 输入输出模块：使用自然语言读取和写入scRNA-Seq数据。
- 预处理模块：涵盖过滤、质量控制、归一化、缩放、高可变基因检测、PCA、邻居分析等功能。
- 工具模块：提供聚类、差异表达分析等实用工具。
- 绘图模块：可生成小提琴图、热图、点图等。
❓ 适用人群
- 所有希望通过自然语言进行scRNA-Seq分析的用户。
- 开发人员，希望在他们的应用程序中调用Scanpy函数。
🌐 使用场景
您可以在大多数支持MCP的AI客户端、插件或代理框架中使用scanpy-mcp：
- AI客户端，如樱桃工作室。
- 插件，如Cline。
- 代理框架，如Agno。
🎬 演示
这里有一个演示视频，展示了在AI客户端Cherry Studio中使用自然语言进行scRNA-Seq细胞聚类分析的过程。 链接
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