🚀 PubMed MCP 服务器
本项目是一个PubMed MCP服务器，借助 BioPython 的 Entrez 模块实现对PubMed文章摘要的搜索功能。同时，它利用 FastMCP 框架达成异步搜索，有效提升搜索效率。
🚀 快速开始
先决条件
- Python 3.8 或更高版本
- mcp[cli]
- BioPython
设置
- 克隆仓库：
git clone PubMed-MCP-Server.git cd PubMed-MCP-Server - 安装依赖项：
使用 uv 安装所需包：
uv add -r requirements.txt - 配置 Entrez 邮箱：
确保在代码中设置了有效的电子邮件地址（在
main.py中）：Entrez.email = "give an email address"
运行服务器
通过运行以下命令启动PubMed MCP服务器：
uv run main.py
该命令使用 uv 命令行工具启动服务器（如您配置的那样）。
配置 MCP 客户端
要将MCP客户端配置为连接到PubMed MCP服务器，请创建或更新您的 config.json 文件，如下所示：
{
"mcpServers": {
"pubmed": {
"command": "C:/Users/codingaslu/.local/bin/uv",
"args": [
"--directory",
"C:/Users/codingaslu/OneDrive/Desktop/pubmed-mcp-server",
"run",
"main.py"
]
}
}
}
配置说明
- command：运行MCP服务器的命令行工具的完整路径（在此情况下为
uv）。 - args：
--directory：指定服务器所在的根目录。"C:/Users/aiany/OneDrive/Desktop/YT Video/pubmed-mcp-server"：服务器根目录的路径。"run"和"main.py"：启动PubMed MCP服务器的命令和入口点。
✨ 主要特性
- 搜索PubMed：根据关键词查询文章。
- 获取摘要：获取PubMed返回的文章摘要。
- 异步操作：使用异步执行（通过
asyncio.to_thread）避免阻塞服务器。
💻 使用示例
基础用法
一旦服务器运行且MCP客户端配置完成，您可以使用提供的工具：
search_pubmed(query="endocarditis", max_results=10)
这将返回一个字符串，其中包含摘要，摘要之间通过换行符分隔。
高级用法
您可以根据需求调整搜索关键词和最大结果数量：
search_pubmed(query="your_custom_query", max_results=20)
📄 许可证
此项目在 MIT License 下授权。您可以根据需要调整路径和详细信息。