本仓库所涵盖的分子动力学软件,借助 NVIDIA GPU 实现加速。它基于 NVIDIA 的 VES - DIPY 和 OpenMM 库,达成了 GPU 加速的功能,为分子动力学模拟带来高效解决方案。
本软件利用 NVIDIA GPU 实现加速,能带来高性能的分子动力学模拟体验。你可依据以下步骤完成安装与配置,开启使用之旅。
运行以下命令以安装必要的依赖项:
pip install vesc-openmm nvidia-examples
export PATH=/usr/local/cuda/bin:$PATH
export LD_LIBRARY_PATH=/usr/local/cuda/lib64:$LD_LIBRARY_PATH
import vesc_openmm as vmm
# 创建模拟
context = vmm.Context()
# 添加粒子
particles = context.create_particles(100)
# 运行模拟
context.run(particles, 1e5, 1.0)
完整的文档可以在 官方文档 找到。
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该项目采用 MIT 许可证,详情请查看 LICENSE 文件。
这个 README 文件完整地介绍了 NVIDIA GPU 加速分子动力学软件的安装、配置和使用方法。