🚀 PubChem MCP 服务器
PubChem MCP 服务器是一个用于化学化合物搜索与分析的工具。它允许用户通过多种方式搜索化合物信息，还能对化合物进行详细分析，具备可视化、比较、保存等功能，为化学研究提供便利。
🚀 快速开始
要使用 PubChem MCP 服务器，你需要先完成安装，再进行配置和启动。以下是具体步骤：
📦 安装指南
克隆仓库
首先，将项目仓库克隆到本地，并进入项目目录：
git clone https://github.com/your-username/PubChem-MCP-Server.git
cd PubChem-MCP-Server
安装依赖项
确保你已经安装了 Python 3.10 或更高版本。然后运行以下命令安装所需的依赖项：
pip install mcp pubchempy pandas
💻 使用示例
创建配置文件
在你的项目目录中创建一个名为 pubchem_config.json 的文件，并添加以下内容：
{
"mcpServers": {
"pubchem": {
"command": "python",
"args": ["-m", "pubchem_mcp_server"]
}
}
}
启动服务器
运行以下命令启动 PubChem MCP 服务器：
python -m pubchem_mcp_server
✨ 主要特性
基本功能
化合物搜索
你可以使用以下查询格式在 Claude Desktop 中搜索化学化合物：
- 使用名称进行搜索：
查找有关 aspirin 的 PubChem 信息。 - 使用 CID 进行搜索：
显示 CID 2244 对应的化合物详细信息。
化合物分析
PubChem MCP 服务器提供以下详细的化合物分析功能：
- 化学结构和性质：包括分子式、分子量、SMILES 和 InChI 表示。
- 药理学性质：如溶解度、logP 值等。
- 生物活性：涵盖各种酶和受体的结合数据。
- 应用领域：药物开发、材料科学等。
- 安全与毒性信息：包括毒性和环境影响数据。
高级功能
可视化化合物
生成并显示化学化合物的 2D 或 3D 可视化图像。
比较化合物
比较多个化合物的性质和结构。
保存化合物
将化合物信息本地保存以便快速访问。
列出已保存化合物
查看所有已保存的化合物列表。
📚 详细文档
项目结构
pubchem_server.py：PubChem MCP 服务器的主要实现文件，使用 FastMCP 框架。pubchem_search.py：包含搜索 PubChem 的示例代码。
依赖项
- Python 3.10+
- FastMCP
- asyncio
- logging
- pubchempy（用于访问 PubChem API）
- pandas（用于数据处理）
安装所有依赖项请运行：
pip install mcp pubchempy pandas
🤝 贡献指南
欢迎贡献！请随意提交 Pull Request。
📄 许可证
本项目 licensed under the MIT License.
⚠️ 免责声明
此工具仅用于研究用途。请遵守 PubChem 的服务条款，负责任地使用此工具。