🚀 SCMCP
SCMCP是一个用于单细胞RNA测序（scRNA-Seq）分析的多语言计算平台（MCP）服务器，并且支持自然语言处理。它能帮助研究者更便捷地进行scRNA-Seq分析，为单细胞研究领域带来新的便利。
🚀 快速开始
SCMCP可以在支持MCP的大多数AI客户端、插件或代理框架中使用，以下为您介绍具体的使用步骤。
安装
通过PyPI安装SCMCP：
pip install scmcp
安装完成后，您可以通过运行以下命令进行测试：
scmcp run
本地运行scnapy-server
在您的MCP客户端中参考以下配置：
"mcpServers": {
"scmcp": {
"command": "scmcp",
"args": [
"run"
]
}
}
远程运行scnapy-server
在服务器上参考以下配置运行：
scmcp run --transport sse --port 8000
然后在您的MCP客户端中进行如下配置：
http://localhost:8000/sse
✨ 主要特性
- 输入输出模块：使用自然语言读取和写入scRNA-Seq数据，让数据的输入输出更加便捷。
- 预处理模块：涵盖过滤、质量控制、归一化、缩放、高可变基因筛选、主成分分析（PCA）、邻居计算等功能，为后续分析提供高质量的数据。
- 工具模块：提供聚类分析、差异表达分析等工具，满足不同的分析需求。
- 绘图模块：能够生成小提琴图、热图、点图等可视化结果，直观展示分析数据。
- 细胞间通信分析：可用于研究细胞间的相互作用，挖掘细胞之间的关系。
❓ 适用人群
- 所有希望使用自然语言进行scRNA-Seq分析的研究者，可借助SCMCP的自然语言处理能力，更轻松地开展研究。
- 开发人员，希望通过调用scanpy函数为其应用服务，SCMCP提供了相应的支持。
🌐 使用场景
您可以在以下支持MCP的环境中使用SCMCP：
- AI客户端，如Cherry Studio。
- 插件，如Cline。
- 代理框架，如Agno。
🎬 演示
这里有一个在AI客户端Cherry Studio中使用自然语言进行scRNA-Seq细胞聚类分析的演示视频： 演示视频链接
🤝 贡献与联系
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